Este libro cuenta la historia de un niño llamado Bruno que vivía en Berlín, pero un día llega de la escuela y se encuentra con que todas las cosas de su casa estaban recogidas, es entonces cuando Bruno se entera de que se mudaban al centro de Alemania porque su padre, un comandante, había sido destinado allí. Al oír esto Bruno se pone muy triste, ya que él no quería abandonar a sus amigos, ni el lugar donde él había vivido siempre.
Al llegar a Alemania, Bruno ve su nueva casa, pero esta no le gustaba porque era más pequeña que la que tenía cuando vivía en Berlín. Al principio Bruno, durante su estancia en Alemania, no tenía ningún amigo, y se aburría mucho allí. Pero un día Bruno decide ir a ver una alambrada que se veía desde la ventana de su habitación. Junto a esta alambrada, se encuentra con un niño llamado Samuel, con el entabla amistad, y todos los días estos dos niños se ven, hablan y juegan juntos a través de la alambrada.
Un día Bruno recibe la noticia de que se muda de nuevo a Berlín, donde antes vivía, entonces va a despedirse de él, y este le cuenta que su padre había desaparecido y que lo andaba buscando pero que no lo encontraba. Entonces Samuel le pide a Bruno que le ayude a buscarlo, y Bruno decide participar, debido a que él se lo tomo como un juego y a él este tipo de juegos le gustaba. Al día siguiente Samuel le trae a Bruno un pijama de rayas, y se cuela al campo de concentración donde estaba Samuel por un agujero de la valla. Pasan los días y los padres de Bruno no encuentran a Bruno, nadie sabe nada de él y la búsqueda de Bruno se continua sin obtener resultado.
